课程内容要与企业、行业的工作任务一致，能力培养应满足企业、行业需求，因此在课程设计中充分体现了检验项目与企业真实任务对接、检验方法与国家标准对接、检验范围与国家职业标准对接、检验对象与产品对接、教学过程与工作过程对接、学生与企业员工对接。使学生在学校直接获得模拟的企业工作环境、工作程序、工作任务和心理体验，为学生未来满足企业要求提供条件。课程通过企业调研获得食品企业微生物检验职业行动领域，结合师资和实训基本条件，按照学生职业发展规律和知识技能的复杂程度，筛选出典型的、具备可操作性的真实企业工作任务，对工作任务中包含的关键技能点进行分析，按照突出重点、覆盖全面、难易结合的原则，将工作任务解构，形成“以微生物基本技能为切入点，以企业微生物典型检验任务为着力点”的课程总体框架。课程共分为：序言、微生物基本操作技能（微生物形态、微生物消毒灭菌技术、微生物培养基配制技术、微生物接种技术、微生物分离纯化技术）、食品中的微生物、食品微生物检验（菌落总数、大场菌群、霉菌和酵母）、环境微生物检验和食品微生物检验室管理等6部分。